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Secuenciación de RNA (Análisis de transcriptoma completo mediante NGS)
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Características generales:

Kit de preparación de librería
Enriquecimento de RNA
Equipo de secuenciación
MGIEasy RNA Library Prep
Incluye depleción de RNA
DNBSEQ-G400 (MGI)

Características técnicas:

Output de secuencia: 50M a 80M de reads por muestra
Paired-End 100 pb
Calidad: Q30>85%

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MGIEasy RNA Library Prep
Enriquecimento de RNA
Incluye depleción de RNA
Equipo de secuenciación
DNBSEQ-G400 (MGI)

Características técnicas:

Output de secuencia: 50M a 80M de reads por muestra
Paired-End 100 pb
Calidad: Q30>85%

Tipo de muestras recibidas

Sangre periférica

RNA extraído
Médula ósea
Tejido embebido en parafina (por ej: tumor)

Requerimientos de la muestra
cuando es RNA extraído

Concentración
200-400 ng
Integridad por espectrometría (nanodrop)
OD260/280=1.8~ 2.0, OD260/230≥2
RIN
≥7

Tiempo de entrega

35 días calendario

Archivos entregados

  • Archivos .fastq (dos a cuatro archivos por muestra).
  • Peso promedio de los archivos = 10-12Gb (Se transfieren a través de cuenta FTP de acceso exclusivo para cada usuario).

Aplicaciones

  • Perfiles de expresión génica.
  • Búsqueda de nuevos transcritos.
  • Fusión génica.
  • Modificaciones postraduccionales.
  • Empalme de ARN.
  • Isoformas de ARN únicas.
  • Regulación génica, entre otros.<//li>

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